药师灌顶真言
南谟薄伽伐帝。鞞杀社。窭噜薜琉璃。钵喇婆。喝啰阇也。怛他揭多也。
阿啰喝帝。三藐三勃陀耶。怛姪他。唵。鞞杀逝。鞞杀逝。鞞杀社。三没揭帝。莎诃。
药师灌顶真言（全咒），点击文字可打开
药师灌顶真言（全咒）:
南无薄伽伐帝。鞞杀社。窭噜薜琉璃。 钵喇婆。喝啰阇也。
怛他揭多也。阿啰喝帝。三藐三勃陀耶。怛侄他。
唵。鞞杀逝。鞞杀逝。鞞萨社。三没揭帝。莎诃。（药师琉璃光七佛本愿功德经）
námó bóqiéfádì, píshāshè, jùlū bìliúlí, bōlǎpó, hèlàshéyě,
dátuōjiēduōyē, ē là hè dì, sānmiǎo sānbótuóyē, dázhítuō,
ān, píshāshì, píshāshì, píshāshè, sānmòjiēdì, suōhē.（现代汉语拼音）
namo bhagavate bhaiṣajya-guru vaiḍūrya prabha rājāya
tathāgatāya arhate samyaksambuddhāya tadyathā:
oṃ bhaiṣajye bhaiṣajye bhaiṣajya-samudgate svāhā.（梵语）
南无世尊 药-师 琉璃 光 王
如来 应供 正等正觉 即说咒曰：
唵 药 药 药效-升起 娑婆诃（圆满）。（梵语原义）
南摩巴嘎哇帝 白沙佳 古鲁 外度利亚 钵拉巴拉佳亚
大塔嘎大亚 阿尔哈帝 三藐三布达亚 大地亚塔
唵 白沙界 白沙界 白沙佳沙母嘎帝 娑哇 哈（现代汉语音译）
经里头说，药师如来入了三昧，这个三昧的名字，叫做除灭一切众生苦恼。药师如来入定后，从肉髻里头，放出大光明来，光里头就说这一篇咒。咒说完了，佛再放光，所有一切众生种种的苦处，就一时都消灭完了。
根据《药师经》的描述，可以知道这篇咒是药师佛为了解除众生身心的病苦，入于“除灭一切众生苦恼”三摩地而说的咒语，因此本经特别强调了持咒治病的利益。经中说如果有亲友生病，可以对着食物、药品或净水，至心诵持一百零八遍，再让病人服食，以消除病苦、安乐身心。念咒除病，最好是由病人自己念诵，如果是病情沉重无法自己修持，也可以由亲友代为持念。
太虚大师在《药师本愿经讲记》中也说，药师佛由大愿起大悲、入大定、放大智光而说此咒，因此咒语本身便含摄了药师如来的悲与智，只要摄心诵持，自然能与药师如来的慈悲愿力感应道交。
